contributeurs "Popular Mechanics" et biodiesel amateur Dave Hubbard dit que le problème principal avec le biodiesel est son manque de compatibilité avec les nouveaux moteurs. Hubbard explique que jusqu'en 2007, tous les moteurs diesel sont compatibles avec B100 - biodiesel pur. En 2007, la US Environmental Protection Agency (EPA) progressive de nouvelles normes d'émissions et les fabricants de moteurs diesel repensé leurs systèmes d'injection de carburant pour les rencontrer. Cependant, ces moteurs remaniés sont conçus pour le diesel de pétrole, pas de biodiesel, et ne peuvent tolérer biodiesel en petites quantités, dit Hubbard.
Dégradabilité
Même en pré-2007 moteurs diesel, le biodiesel peut causer certains problèmes. Selon un article publié dans la revue «carburant diesel Nouvelles» en 2000, bien que «la dégradabilité" de biodiesel (comme dans «biodégradable») est un argument de vente, cette qualité peut conduire à la corrosion du moteur. Selon un groupe d'injecteur de carburant fabricants d'équipements cités dans l'article, le biodiesel peut "corroder les injecteurs de carburant, provoquent des défaillances d'étanchéité en élastomère, conduisent à alimenter le blocage du système, provoquer des convulsions de la pompe, provoquer injecteur de carburant pulvérisation blocage du trou et la pression d'injection d'augmentation."
coût de production et la disponibilité
Selon l'EIA, le coût élevé de l'utilisation de l'huile de soja pour fabriquer du biodiesel et de la disponibilité des intrants rares de biodiesel moins chers, comme le jaune graisse, il est difficile pour le biodiesel de rivaliser commercialement avec du diesel de pétrole.